上海伊斯蘭教現(xiàn)有7坊清真寺和1處固定處所，阿訇18人，信仰伊斯蘭教的10個(gè)少數(shù)民族戶籍人口達(dá)8.5萬多人。
伊斯蘭教于公元七世紀(jì)初經(jīng)由穆罕默德的傳播而興起于阿拉伯半島，后發(fā)展為世界性宗教之一。唐永徽二年（651年）傳入中國(guó)。亦稱"清真教"、"天方教"、"回回教"，民國(guó)時(shí)期多稱為"回教"。1956年6月2日起，國(guó)內(nèi)統(tǒng)稱為"伊斯蘭教"，其教徒統(tǒng)稱"穆斯林"。
伊斯蘭教傳入上海始于元代。至元十四年建立松江府，沙全任松江府達(dá)魯花赤，元軍官兵及家屬遂定居松江，其中有信奉伊斯蘭教的穆斯林，從而把該教帶入上海。元至正年間（1341-1868年），在松江府西景家堰北與"回回"接壤處，建立了上海地區(qū)第一座清真寺--松江真教寺。
明代，有回回將領(lǐng)駐守金山衛(wèi)和嘉定等地。明天順年間（1457-1464年），明朝為鞏固海防又將在西北地區(qū)甘州、涼州的2千多名"寄居回回"、"歸屬回回"遷徙到江南各衛(wèi)（包括上海金山衛(wèi)）。明萬歷元年（1573年），青浦縣聚星街增建了一所"真教祠"。
上海開埠以后，來滬謀生的穆斯林人數(shù)增多，并陸續(xù)建造了草鞋灣清真寺（俗稱南寺）、穿心街清真寺（俗稱北寺）、浙江路回教堂（俗稱外國(guó)寺）、滬西清真寺、清真女寺、小桃園清真寺等。
1937年"八一三"日軍侵犯上海，使上海穆斯林生命財(cái)產(chǎn)蒙受慘重?fù)p失，有4座清真寺（含2座女寺）毀于日軍戰(zhàn)火，數(shù)千穆斯林難民流離失所，多數(shù)伊斯蘭教社團(tuán)和雜志被迫解散和?？?。與此同時(shí)，也激發(fā)了上海穆斯林愛國(guó)愛教精神的發(fā)揚(yáng)，和全國(guó)人民一道同仇敵愾共同抗日。
上海解放后，黨和政府注意提高少數(shù)民族的政治地位，關(guān)心伊斯蘭教工作。中共十一屆三中全會(huì)以后，重新落實(shí)民族宗教政策，穆斯林的宗教信仰和正當(dāng)?shù)淖诮袒顒?dòng)受到尊重和保護(hù)。1979年6月，上海市伊斯蘭教協(xié)會(huì)恢復(fù)工作，在協(xié)助政府有關(guān)部門落實(shí)宗教政策，平反糾正伊斯蘭教界冤假錯(cuò)案，恢復(fù)開放清真寺，培養(yǎng)年輕阿訇、恢復(fù)和開展伊斯蘭文化工作，協(xié)助政府妥善處理突發(fā)事件，開展同國(guó)內(nèi)外穆斯林友好交往，努力實(shí)現(xiàn)宗教自養(yǎng)等方面做了許多工作。市、區(qū)人民政府對(duì)滬西清真寺、浦東清真寺和江灣清真寺的移地重建、上海清真女寺的恢復(fù)以及對(duì)小桃園清真寺、松江清真寺的修繕工作給予政策上的支持并多次撥款。
上海市伊斯蘭教協(xié)會(huì)設(shè)在小桃園清真寺內(nèi)。2012年2月，在上海市伊斯蘭教協(xié)會(huì)第八次代表會(huì)議上，產(chǎn)生了新一屆領(lǐng)導(dǎo)班子，金宏偉任會(huì)長(zhǎng)，白潤(rùn)生、方宗偉、花以友、趙學(xué)義任副會(huì)長(zhǎng)，方宗偉兼任秘書長(zhǎng)。
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